Das traditionelle Wappen der Einwohnergemeinde Wynau bleibt nach wie vor bestehen. Hingegen hat die Einwohnergemeinde Wynau ab dem Jahre 2008 ein neues Erscheinungsbild erhalten. Das blaue N im Schriftzug Wynau symbolisiert den markanten Aare-Cheer (Aare-Knie) in Wynau. Damit soll unter anderem auch ein Bezug zum Naherholungsgebiet an der Aare geschaffen werden. Die Aarelandschaft in Wynau ist  ein einmaliges Landschaftsgut von nationaler Bedeutung.