Das oberste Organ sind die 1'100 Stimmberechtigten. Unter den rund 400 politischen Gemeinden des Kantons Bern gehört Wynau zu den "mittleren" Gemeinden mit ca. 1'600 EinwohnerInnen.

Wynau verfügt über kein Parlament, die Stimmberechtigten (Legislative) entscheiden an den Gemeindeversammlungen und an der Urne.

Der Gemeinderat ist die Exekutive. Diese besteht einschliesslich dem Präsidium aus fünf Mitgliedern (nebenamtlich). Zusätzlich bestehen 4 ständige Kommissionen. Alle vier Jahre finden Wahlen statt. Die aktuelle Amtsdauer endet am 31.12.2014.